El bus PCI Express x16 no solo ofrecerá mayor ancho de banda y potencia eléctrica, sino también añadirá ciertas funcionalidades al protocolo de transferencia que pueden aumentar notablemente el rendimiento en ciertos casos.

Intel, teniendo en mente los actuales problemas de refrigeración de las modernas GPUs, también ofrece algunas recomendaciones de diseño para mejorar la disipación.

Intel entiende que las futuras generaciones de procesadores gráficos diseñados para PCI Express x16 consumirán más energía que las actuales GPUs y VPUs. Por esto, el slot PCI Express 16x podrá proporcionar hasta 75W de potencia para las nuevas tarjetas gráficas. Teniendo en cuenta que algunas tarjetas de gama alta consumen hasta 200W, es posible que sigan siendo necesarios conectores adicionales de alimentación y, por tanto, no sacarán provecho de la potencia extra de la que es capaz PCI Express. De todas formas, también debemos tener en cuenta que las tarjetas de gama media o de consumo también aumentarán su potencia, por lo que serán éstas la que saquen partido de esta característica. Al menos ahora tienen más margen de crecimiento en este aspecto.

Para poder refrigerar estas GPUs y VPUs del futuro, Intel recomienda emplear un disipador con entradas y salidas adecuadas de aire. También recomienda a los fabricantes de cajas instalar una apertura lateral para inyectar aire frío, y así mejorar la refrigeración. Obviamente, los disipadores de las tarjetas gráficas tomarán el aire frío de la apertura, y lanzarán aire caliente al interior de la caja. Para reducir el ruido de los ventiladores, Intel recomienda incluir sensores de temperatura, para así poder ajustar la velocidad de giro al nivel adecuado. Todas estas medidas llevan tiempo implementándose en algunos sistemas; sin embargo, gracias a las recomendaciones de Intel, es posible que se conviertan en un estándar.

Puesto que PCI Express hereda muchas cosas del viejo PCI, el soporte por parte del fabricante puede ser añadido fácilmente en los actuales drivers AGP. Sin embargo, no será compatible con AGP y, tal y como ha comentado ATI, la industria gráfica será "reseteada" por la presentación del PCI Express.

Markhan, una empresa de gráficos por ordenador de Ontario, ha comentado algunas capacidades potenciales de las futuras GPUs basadas en PCI Express, entre las que se encuentran:

• Edición de vídeo con calidad profesional.
• Capacidad de manejar matrices multimonitor (combinar varios monitores como si fuesen uno solo).
• Conexión en caliente de tarjetas gráficas.
• Uso de la VPU como coprocesador.

Un representante de NVIDIA también ha comentado que el manejo eficiente de las transacciones de datos por parte del software puede mejorar el rendimiento hasta un 10%.